Protein–RNA interactions for Protein: Q61660

Foxj1, Forkhead box protein J1, mousemouse

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Length 421 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxj1Q61660 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 Il4-204ENSMUST00000150568 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Foxj1Q61660 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms