Protein–RNA interactions for Protein: Q61474

Msi1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi1Q61474 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms