Protein–RNA interactions for Protein: Q61468

Msln, Mesothelin, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MslnQ61468 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MslnQ61468 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MslnQ61468 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MslnQ61468 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MslnQ61468 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MslnQ61468 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MslnQ61468 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MslnQ61468 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MslnQ61468 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MslnQ61468 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MslnQ61468 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MslnQ61468 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MslnQ61468 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MslnQ61468 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MslnQ61468 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MslnQ61468 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MslnQ61468 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MslnQ61468 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MslnQ61468 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MslnQ61468 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MslnQ61468 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MslnQ61468 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MslnQ61468 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MslnQ61468 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MslnQ61468 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MslnQ61468 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MslnQ61468 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MslnQ61468 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MslnQ61468 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MslnQ61468 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MslnQ61468 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MslnQ61468 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MslnQ61468 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MslnQ61468 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MslnQ61468 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MslnQ61468 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MslnQ61468 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MslnQ61468 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MslnQ61468 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MslnQ61468 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MslnQ61468 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MslnQ61468 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MslnQ61468 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MslnQ61468 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MslnQ61468 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MslnQ61468 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MslnQ61468 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MslnQ61468 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MslnQ61468 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MslnQ61468 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MslnQ61468 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MslnQ61468 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MslnQ61468 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MslnQ61468 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MslnQ61468 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MslnQ61468 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MslnQ61468 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MslnQ61468 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MslnQ61468 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MslnQ61468 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MslnQ61468 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MslnQ61468 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MslnQ61468 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MslnQ61468 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MslnQ61468 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MslnQ61468 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MslnQ61468 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MslnQ61468 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MslnQ61468 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MslnQ61468 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MslnQ61468 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MslnQ61468 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MslnQ61468 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MslnQ61468 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MslnQ61468 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MslnQ61468 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MslnQ61468 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MslnQ61468 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MslnQ61468 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MslnQ61468 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MslnQ61468 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MslnQ61468 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MslnQ61468 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MslnQ61468 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MslnQ61468 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MslnQ61468 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MslnQ61468 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MslnQ61468 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MslnQ61468 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MslnQ61468 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MslnQ61468 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MslnQ61468 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MslnQ61468 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MslnQ61468 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MslnQ61468 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MslnQ61468 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MslnQ61468 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MslnQ61468 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MslnQ61468 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MslnQ61468 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms