Protein–RNA interactions for Protein: Q61458

Ccnh, Cyclin-H, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnhQ61458 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms