Protein–RNA interactions for Protein: Q61412

Vsx2, Visual system homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsx2Q61412 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms