Protein–RNA interactions for Protein: Q61285

Abcd2, ATP-binding cassette sub-family D member 2, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd2Q61285 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Abcd2Q61285 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Abcd2Q61285 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Abcd2Q61285 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Abcd2Q61285 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Abcd2Q61285 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Abcd2Q61285 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Abcd2Q61285 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Abcd2Q61285 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Abcd2Q61285 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Abcd2Q61285 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Abcd2Q61285 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Abcd2Q61285 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Abcd2Q61285 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Abcd2Q61285 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Abcd2Q61285 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Abcd2Q61285 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Abcd2Q61285 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Abcd2Q61285 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Abcd2Q61285 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Abcd2Q61285 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Abcd2Q61285 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Abcd2Q61285 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Abcd2Q61285 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Abcd2Q61285 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Abcd2Q61285 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Abcd2Q61285 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Abcd2Q61285 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Abcd2Q61285 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Abcd2Q61285 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Abcd2Q61285 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Abcd2Q61285 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcd2Q61285 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcd2Q61285 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcd2Q61285 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcd2Q61285 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcd2Q61285 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcd2Q61285 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcd2Q61285 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcd2Q61285 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcd2Q61285 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcd2Q61285 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcd2Q61285 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcd2Q61285 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcd2Q61285 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcd2Q61285 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcd2Q61285 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcd2Q61285 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcd2Q61285 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcd2Q61285 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcd2Q61285 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcd2Q61285 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcd2Q61285 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcd2Q61285 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcd2Q61285 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcd2Q61285 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcd2Q61285 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcd2Q61285 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcd2Q61285 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcd2Q61285 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcd2Q61285 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcd2Q61285 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcd2Q61285 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcd2Q61285 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcd2Q61285 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcd2Q61285 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcd2Q61285 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcd2Q61285 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcd2Q61285 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcd2Q61285 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcd2Q61285 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcd2Q61285 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcd2Q61285 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcd2Q61285 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcd2Q61285 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcd2Q61285 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcd2Q61285 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcd2Q61285 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcd2Q61285 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcd2Q61285 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcd2Q61285 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcd2Q61285 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcd2Q61285 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcd2Q61285 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcd2Q61285 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcd2Q61285 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcd2Q61285 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcd2Q61285 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcd2Q61285 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcd2Q61285 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcd2Q61285 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcd2Q61285 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcd2Q61285 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcd2Q61285 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcd2Q61285 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcd2Q61285 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcd2Q61285 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcd2Q61285 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcd2Q61285 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcd2Q61285 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 221.3 ms