Protein–RNA interactions for Protein: Q61003

Cd6, T-cell differentiation antigen CD6, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd6Q61003 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd6Q61003 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd6Q61003 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd6Q61003 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd6Q61003 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd6Q61003 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd6Q61003 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd6Q61003 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd6Q61003 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd6Q61003 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd6Q61003 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd6Q61003 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd6Q61003 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd6Q61003 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd6Q61003 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd6Q61003 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd6Q61003 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd6Q61003 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd6Q61003 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd6Q61003 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd6Q61003 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd6Q61003 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd6Q61003 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd6Q61003 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd6Q61003 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd6Q61003 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd6Q61003 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd6Q61003 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd6Q61003 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd6Q61003 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd6Q61003 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd6Q61003 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd6Q61003 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd6Q61003 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd6Q61003 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cd6Q61003 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cd6Q61003 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cd6Q61003 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Cd6Q61003 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd6Q61003 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd6Q61003 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd6Q61003 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd6Q61003 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd6Q61003 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd6Q61003 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd6Q61003 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd6Q61003 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd6Q61003 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd6Q61003 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd6Q61003 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd6Q61003 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd6Q61003 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd6Q61003 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd6Q61003 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd6Q61003 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd6Q61003 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd6Q61003 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd6Q61003 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd6Q61003 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd6Q61003 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd6Q61003 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd6Q61003 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd6Q61003 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd6Q61003 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd6Q61003 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd6Q61003 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd6Q61003 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd6Q61003 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd6Q61003 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd6Q61003 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd6Q61003 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd6Q61003 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd6Q61003 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd6Q61003 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd6Q61003 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd6Q61003 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd6Q61003 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd6Q61003 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd6Q61003 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd6Q61003 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd6Q61003 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd6Q61003 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd6Q61003 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd6Q61003 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd6Q61003 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd6Q61003 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd6Q61003 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd6Q61003 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd6Q61003 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd6Q61003 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd6Q61003 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd6Q61003 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd6Q61003 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd6Q61003 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd6Q61003 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd6Q61003 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd6Q61003 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd6Q61003 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd6Q61003 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd6Q61003 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms