Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbbp7Q60973 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbbp7Q60973 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbbp7Q60973 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbbp7Q60973 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbbp7Q60973 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbbp7Q60973 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbbp7Q60973 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbbp7Q60973 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbbp7Q60973 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbbp7Q60973 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbbp7Q60973 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbbp7Q60973 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbbp7Q60973 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbbp7Q60973 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbbp7Q60973 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbbp7Q60973 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbbp7Q60973 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbbp7Q60973 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbbp7Q60973 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbbp7Q60973 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbbp7Q60973 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbbp7Q60973 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbbp7Q60973 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbbp7Q60973 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbbp7Q60973 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbbp7Q60973 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbbp7Q60973 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbbp7Q60973 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbbp7Q60973 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbbp7Q60973 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbbp7Q60973 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbbp7Q60973 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbbp7Q60973 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbbp7Q60973 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbbp7Q60973 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbbp7Q60973 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbbp7Q60973 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbbp7Q60973 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbbp7Q60973 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbbp7Q60973 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbbp7Q60973 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbbp7Q60973 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rbbp7Q60973 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rbbp7Q60973 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rbbp7Q60973 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rbbp7Q60973 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Rbbp7Q60973 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rbbp7Q60973 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rbbp7Q60973 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rbbp7Q60973 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rbbp7Q60973 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rbbp7Q60973 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rbbp7Q60973 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp7Q60973 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp7Q60973 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp7Q60973 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp7Q60973 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp7Q60973 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp7Q60973 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp7Q60973 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp7Q60973 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp7Q60973 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp7Q60973 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp7Q60973 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp7Q60973 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp7Q60973 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp7Q60973 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp7Q60973 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp7Q60973 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp7Q60973 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp7Q60973 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp7Q60973 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp7Q60973 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp7Q60973 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp7Q60973 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp7Q60973 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp7Q60973 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbbp7Q60973 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbbp7Q60973 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbbp7Q60973 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbbp7Q60973 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbbp7Q60973 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbbp7Q60973 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbbp7Q60973 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbbp7Q60973 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbbp7Q60973 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbbp7Q60973 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbbp7Q60973 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbbp7Q60973 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbbp7Q60973 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbbp7Q60973 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbbp7Q60973 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbbp7Q60973 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbbp7Q60973 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbbp7Q60973 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbbp7Q60973 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbbp7Q60973 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbbp7Q60973 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbbp7Q60973 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms