Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms