Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms