Protein–RNA interactions for Protein: Q60846

Tnfrsf8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf8Q60846 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfrsf8Q60846 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfrsf8Q60846 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfrsf8Q60846 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfrsf8Q60846 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfrsf8Q60846 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfrsf8Q60846 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfrsf8Q60846 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfrsf8Q60846 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfrsf8Q60846 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfrsf8Q60846 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfrsf8Q60846 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfrsf8Q60846 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfrsf8Q60846 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfrsf8Q60846 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfrsf8Q60846 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfrsf8Q60846 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfrsf8Q60846 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfrsf8Q60846 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfrsf8Q60846 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfrsf8Q60846 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfrsf8Q60846 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfrsf8Q60846 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfrsf8Q60846 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfrsf8Q60846 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tnfrsf8Q60846 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tnfrsf8Q60846 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tnfrsf8Q60846 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Tnfrsf8Q60846 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tnfrsf8Q60846 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tnfrsf8Q60846 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Tnfrsf8Q60846 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tnfrsf8Q60846 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfrsf8Q60846 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfrsf8Q60846 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfrsf8Q60846 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfrsf8Q60846 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfrsf8Q60846 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfrsf8Q60846 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfrsf8Q60846 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfrsf8Q60846 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfrsf8Q60846 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfrsf8Q60846 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfrsf8Q60846 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfrsf8Q60846 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfrsf8Q60846 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfrsf8Q60846 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfrsf8Q60846 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfrsf8Q60846 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfrsf8Q60846 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfrsf8Q60846 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfrsf8Q60846 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfrsf8Q60846 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfrsf8Q60846 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfrsf8Q60846 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfrsf8Q60846 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfrsf8Q60846 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfrsf8Q60846 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfrsf8Q60846 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfrsf8Q60846 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfrsf8Q60846 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfrsf8Q60846 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfrsf8Q60846 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfrsf8Q60846 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfrsf8Q60846 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfrsf8Q60846 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfrsf8Q60846 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfrsf8Q60846 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfrsf8Q60846 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfrsf8Q60846 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfrsf8Q60846 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfrsf8Q60846 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfrsf8Q60846 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfrsf8Q60846 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfrsf8Q60846 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfrsf8Q60846 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfrsf8Q60846 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfrsf8Q60846 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfrsf8Q60846 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfrsf8Q60846 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfrsf8Q60846 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfrsf8Q60846 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfrsf8Q60846 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfrsf8Q60846 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfrsf8Q60846 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfrsf8Q60846 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfrsf8Q60846 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfrsf8Q60846 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfrsf8Q60846 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfrsf8Q60846 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfrsf8Q60846 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfrsf8Q60846 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfrsf8Q60846 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfrsf8Q60846 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfrsf8Q60846 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfrsf8Q60846 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfrsf8Q60846 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfrsf8Q60846 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfrsf8Q60846 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfrsf8Q60846 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms