Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Traf3Q60803 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Traf3Q60803 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Traf3Q60803 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Traf3Q60803 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Traf3Q60803 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Traf3Q60803 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Traf3Q60803 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Traf3Q60803 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Traf3Q60803 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Traf3Q60803 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Traf3Q60803 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf3Q60803 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf3Q60803 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf3Q60803 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf3Q60803 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf3Q60803 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf3Q60803 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf3Q60803 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf3Q60803 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf3Q60803 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf3Q60803 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf3Q60803 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf3Q60803 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf3Q60803 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf3Q60803 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf3Q60803 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf3Q60803 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf3Q60803 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf3Q60803 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf3Q60803 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf3Q60803 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf3Q60803 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf3Q60803 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf3Q60803 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Traf3Q60803 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Traf3Q60803 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Traf3Q60803 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Traf3Q60803 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Traf3Q60803 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Traf3Q60803 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Traf3Q60803 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Traf3Q60803 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Traf3Q60803 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Traf3Q60803 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Traf3Q60803 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Traf3Q60803 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Traf3Q60803 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Traf3Q60803 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Traf3Q60803 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Traf3Q60803 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Traf3Q60803 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Traf3Q60803 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Traf3Q60803 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Traf3Q60803 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Traf3Q60803 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Traf3Q60803 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Traf3Q60803 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Traf3Q60803 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Traf3Q60803 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Traf3Q60803 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Traf3Q60803 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Traf3Q60803 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Traf3Q60803 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Traf3Q60803 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Traf3Q60803 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Traf3Q60803 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Traf3Q60803 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Traf3Q60803 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Traf3Q60803 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Traf3Q60803 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Traf3Q60803 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Traf3Q60803 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Traf3Q60803 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf3Q60803 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf3Q60803 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf3Q60803 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf3Q60803 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf3Q60803 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf3Q60803 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf3Q60803 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf3Q60803 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf3Q60803 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf3Q60803 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf3Q60803 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf3Q60803 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf3Q60803 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf3Q60803 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf3Q60803 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf3Q60803 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf3Q60803 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf3Q60803 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf3Q60803 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf3Q60803 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf3Q60803 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf3Q60803 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf3Q60803 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf3Q60803 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf3Q60803 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf3Q60803 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms