Protein–RNA interactions for Protein: Q60772

Cdkn2c, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor C, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2cQ60772 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms