Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atf3Q60765 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Atf3Q60765 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atf3Q60765 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atf3Q60765 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atf3Q60765 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atf3Q60765 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atf3Q60765 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atf3Q60765 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Atf3Q60765 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atf3Q60765 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atf3Q60765 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atf3Q60765 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atf3Q60765 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atf3Q60765 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atf3Q60765 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atf3Q60765 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Atf3Q60765 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atf3Q60765 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atf3Q60765 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atf3Q60765 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atf3Q60765 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atf3Q60765 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atf3Q60765 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atf3Q60765 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atf3Q60765 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atf3Q60765 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Atf3Q60765 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atf3Q60765 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atf3Q60765 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atf3Q60765 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atf3Q60765 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atf3Q60765 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atf3Q60765 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atf3Q60765 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atf3Q60765 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atf3Q60765 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atf3Q60765 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atf3Q60765 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atf3Q60765 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atf3Q60765 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atf3Q60765 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atf3Q60765 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atf3Q60765 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Atf3Q60765 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atf3Q60765 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atf3Q60765 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atf3Q60765 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atf3Q60765 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atf3Q60765 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atf3Q60765 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atf3Q60765 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Atf3Q60765 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atf3Q60765 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atf3Q60765 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Atf3Q60765 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atf3Q60765 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atf3Q60765 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atf3Q60765 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atf3Q60765 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atf3Q60765 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atf3Q60765 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atf3Q60765 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atf3Q60765 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Atf3Q60765 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Atf3Q60765 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Atf3Q60765 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Atf3Q60765 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Atf3Q60765 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Atf3Q60765 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Atf3Q60765 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Atf3Q60765 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Atf3Q60765 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Atf3Q60765 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atf3Q60765 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atf3Q60765 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atf3Q60765 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atf3Q60765 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atf3Q60765 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atf3Q60765 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atf3Q60765 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atf3Q60765 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atf3Q60765 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atf3Q60765 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Atf3Q60765 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Atf3Q60765 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atf3Q60765 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atf3Q60765 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Atf3Q60765 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atf3Q60765 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atf3Q60765 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atf3Q60765 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atf3Q60765 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atf3Q60765 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atf3Q60765 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atf3Q60765 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atf3Q60765 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Atf3Q60765 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atf3Q60765 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atf3Q60765 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms