Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mkrn3Q60764 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mkrn3Q60764 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mkrn3Q60764 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mkrn3Q60764 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mkrn3Q60764 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mkrn3Q60764 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mkrn3Q60764 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mkrn3Q60764 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mkrn3Q60764 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mkrn3Q60764 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mkrn3Q60764 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Mkrn3Q60764 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mkrn3Q60764 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mkrn3Q60764 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mkrn3Q60764 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mkrn3Q60764 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mkrn3Q60764 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mkrn3Q60764 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mkrn3Q60764 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mkrn3Q60764 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mkrn3Q60764 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mkrn3Q60764 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mkrn3Q60764 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mkrn3Q60764 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mkrn3Q60764 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mkrn3Q60764 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mkrn3Q60764 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mkrn3Q60764 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mkrn3Q60764 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mkrn3Q60764 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mkrn3Q60764 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mkrn3Q60764 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mkrn3Q60764 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mkrn3Q60764 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mkrn3Q60764 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mkrn3Q60764 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mkrn3Q60764 Gm17193-201ENSMUST00000116345 691 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mkrn3Q60764 Gm16140-201ENSMUST00000117191 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mkrn3Q60764 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Mkrn3Q60764 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mkrn3Q60764 Gm26952-201ENSMUST00000181996 409 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mkrn3Q60764 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mkrn3Q60764 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Mkrn3Q60764 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Mkrn3Q60764 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mkrn3Q60764 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mkrn3Q60764 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mkrn3Q60764 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mkrn3Q60764 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mkrn3Q60764 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mkrn3Q60764 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mkrn3Q60764 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mkrn3Q60764 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mkrn3Q60764 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mkrn3Q60764 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mkrn3Q60764 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mkrn3Q60764 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mkrn3Q60764 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mkrn3Q60764 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mkrn3Q60764 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mkrn3Q60764 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mkrn3Q60764 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mkrn3Q60764 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mkrn3Q60764 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Mkrn3Q60764 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mkrn3Q60764 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mkrn3Q60764 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mkrn3Q60764 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mkrn3Q60764 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Mkrn3Q60764 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mkrn3Q60764 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mkrn3Q60764 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mkrn3Q60764 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Mkrn3Q60764 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Mkrn3Q60764 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Mkrn3Q60764 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Mkrn3Q60764 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Mkrn3Q60764 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Mkrn3Q60764 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Mkrn3Q60764 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Mkrn3Q60764 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Mkrn3Q60764 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Mkrn3Q60764 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mkrn3Q60764 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mkrn3Q60764 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mkrn3Q60764 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mkrn3Q60764 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mkrn3Q60764 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mkrn3Q60764 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mkrn3Q60764 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mkrn3Q60764 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mkrn3Q60764 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mkrn3Q60764 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mkrn3Q60764 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mkrn3Q60764 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Mkrn3Q60764 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mkrn3Q60764 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mkrn3Q60764 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Mkrn3Q60764 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms