Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms