Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prdm1Q60636 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prdm1Q60636 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prdm1Q60636 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prdm1Q60636 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Prdm1Q60636 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prdm1Q60636 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prdm1Q60636 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prdm1Q60636 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Prdm1Q60636 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Prdm1Q60636 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Prdm1Q60636 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prdm1Q60636 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prdm1Q60636 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prdm1Q60636 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Prdm1Q60636 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prdm1Q60636 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prdm1Q60636 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prdm1Q60636 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prdm1Q60636 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prdm1Q60636 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Prdm1Q60636 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prdm1Q60636 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prdm1Q60636 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prdm1Q60636 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prdm1Q60636 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prdm1Q60636 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prdm1Q60636 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prdm1Q60636 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prdm1Q60636 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms