Protein–RNA interactions for Protein: Q60632

Nr2f1, COUP transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2f1Q60632 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nr2f1Q60632 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nr2f1Q60632 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nr2f1Q60632 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nr2f1Q60632 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nr2f1Q60632 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nr2f1Q60632 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Nr2f1Q60632 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nr2f1Q60632 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nr2f1Q60632 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nr2f1Q60632 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nr2f1Q60632 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nr2f1Q60632 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nr2f1Q60632 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nr2f1Q60632 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nr2f1Q60632 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nr2f1Q60632 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nr2f1Q60632 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nr2f1Q60632 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Nr2f1Q60632 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Nr2f1Q60632 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Nr2f1Q60632 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Nr2f1Q60632 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nr2f1Q60632 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nr2f1Q60632 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nr2f1Q60632 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Nr2f1Q60632 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nr2f1Q60632 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nr2f1Q60632 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nr2f1Q60632 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nr2f1Q60632 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nr2f1Q60632 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nr2f1Q60632 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nr2f1Q60632 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nr2f1Q60632 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nr2f1Q60632 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nr2f1Q60632 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nr2f1Q60632 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nr2f1Q60632 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nr2f1Q60632 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nr2f1Q60632 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nr2f1Q60632 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nr2f1Q60632 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nr2f1Q60632 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nr2f1Q60632 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nr2f1Q60632 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nr2f1Q60632 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nr2f1Q60632 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Nr2f1Q60632 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nr2f1Q60632 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nr2f1Q60632 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nr2f1Q60632 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nr2f1Q60632 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nr2f1Q60632 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nr2f1Q60632 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nr2f1Q60632 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Nr2f1Q60632 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nr2f1Q60632 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nr2f1Q60632 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nr2f1Q60632 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nr2f1Q60632 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nr2f1Q60632 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nr2f1Q60632 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nr2f1Q60632 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nr2f1Q60632 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nr2f1Q60632 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nr2f1Q60632 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nr2f1Q60632 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nr2f1Q60632 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nr2f1Q60632 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nr2f1Q60632 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nr2f1Q60632 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nr2f1Q60632 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nr2f1Q60632 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nr2f1Q60632 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nr2f1Q60632 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nr2f1Q60632 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nr2f1Q60632 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nr2f1Q60632 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nr2f1Q60632 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nr2f1Q60632 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nr2f1Q60632 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nr2f1Q60632 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nr2f1Q60632 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nr2f1Q60632 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nr2f1Q60632 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nr2f1Q60632 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nr2f1Q60632 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nr2f1Q60632 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nr2f1Q60632 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nr2f1Q60632 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nr2f1Q60632 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nr2f1Q60632 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nr2f1Q60632 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nr2f1Q60632 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nr2f1Q60632 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nr2f1Q60632 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nr2f1Q60632 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nr2f1Q60632 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nr2f1Q60632 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms