Protein–RNA interactions for Protein: Q5U458

Dnajc11, DnaJ homolog subfamily C member 11, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc11Q5U458 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms