Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

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Length 803 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Tsr1Q5SWD9 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tsr1Q5SWD9 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tsr1Q5SWD9 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tsr1Q5SWD9 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tsr1Q5SWD9 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tsr1Q5SWD9 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Tsr1Q5SWD9 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tsr1Q5SWD9 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tsr1Q5SWD9 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tsr1Q5SWD9 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tsr1Q5SWD9 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tsr1Q5SWD9 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tsr1Q5SWD9 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Tsr1Q5SWD9 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Tsr1Q5SWD9 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tsr1Q5SWD9 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Tsr1Q5SWD9 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Tsr1Q5SWD9 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Tsr1Q5SWD9 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Tsr1Q5SWD9 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tsr1Q5SWD9 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Tsr1Q5SWD9 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tsr1Q5SWD9 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tsr1Q5SWD9 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tsr1Q5SWD9 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tsr1Q5SWD9 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tsr1Q5SWD9 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Tsr1Q5SWD9 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tsr1Q5SWD9 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tsr1Q5SWD9 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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