Protein–RNA interactions for Protein: Q5STT6

Fam71b, Protein FAM71B, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71bQ5STT6 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam71bQ5STT6 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam71bQ5STT6 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam71bQ5STT6 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam71bQ5STT6 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam71bQ5STT6 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam71bQ5STT6 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam71bQ5STT6 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam71bQ5STT6 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam71bQ5STT6 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam71bQ5STT6 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam71bQ5STT6 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam71bQ5STT6 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam71bQ5STT6 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam71bQ5STT6 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam71bQ5STT6 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam71bQ5STT6 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam71bQ5STT6 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam71bQ5STT6 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam71bQ5STT6 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam71bQ5STT6 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam71bQ5STT6 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam71bQ5STT6 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam71bQ5STT6 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam71bQ5STT6 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam71bQ5STT6 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam71bQ5STT6 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam71bQ5STT6 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam71bQ5STT6 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam71bQ5STT6 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam71bQ5STT6 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam71bQ5STT6 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam71bQ5STT6 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam71bQ5STT6 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam71bQ5STT6 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam71bQ5STT6 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam71bQ5STT6 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam71bQ5STT6 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam71bQ5STT6 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam71bQ5STT6 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam71bQ5STT6 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam71bQ5STT6 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam71bQ5STT6 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam71bQ5STT6 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam71bQ5STT6 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam71bQ5STT6 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam71bQ5STT6 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam71bQ5STT6 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam71bQ5STT6 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam71bQ5STT6 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam71bQ5STT6 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam71bQ5STT6 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam71bQ5STT6 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam71bQ5STT6 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam71bQ5STT6 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam71bQ5STT6 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam71bQ5STT6 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam71bQ5STT6 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam71bQ5STT6 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam71bQ5STT6 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam71bQ5STT6 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam71bQ5STT6 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam71bQ5STT6 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam71bQ5STT6 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam71bQ5STT6 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam71bQ5STT6 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam71bQ5STT6 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam71bQ5STT6 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam71bQ5STT6 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam71bQ5STT6 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam71bQ5STT6 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam71bQ5STT6 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam71bQ5STT6 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam71bQ5STT6 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam71bQ5STT6 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam71bQ5STT6 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam71bQ5STT6 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam71bQ5STT6 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam71bQ5STT6 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam71bQ5STT6 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam71bQ5STT6 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam71bQ5STT6 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam71bQ5STT6 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam71bQ5STT6 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam71bQ5STT6 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam71bQ5STT6 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam71bQ5STT6 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam71bQ5STT6 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam71bQ5STT6 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam71bQ5STT6 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam71bQ5STT6 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam71bQ5STT6 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam71bQ5STT6 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam71bQ5STT6 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam71bQ5STT6 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam71bQ5STT6 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam71bQ5STT6 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam71bQ5STT6 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam71bQ5STT6 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam71bQ5STT6 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms