Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC05

Ttf2, Transcription termination factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf2Q5NC05 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ttf2Q5NC05 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ttf2Q5NC05 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ttf2Q5NC05 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ttf2Q5NC05 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ttf2Q5NC05 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ttf2Q5NC05 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttf2Q5NC05 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttf2Q5NC05 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttf2Q5NC05 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttf2Q5NC05 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttf2Q5NC05 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttf2Q5NC05 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttf2Q5NC05 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttf2Q5NC05 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttf2Q5NC05 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttf2Q5NC05 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttf2Q5NC05 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttf2Q5NC05 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttf2Q5NC05 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttf2Q5NC05 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttf2Q5NC05 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttf2Q5NC05 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttf2Q5NC05 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttf2Q5NC05 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttf2Q5NC05 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttf2Q5NC05 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttf2Q5NC05 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttf2Q5NC05 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttf2Q5NC05 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttf2Q5NC05 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttf2Q5NC05 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttf2Q5NC05 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttf2Q5NC05 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttf2Q5NC05 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttf2Q5NC05 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttf2Q5NC05 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttf2Q5NC05 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttf2Q5NC05 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttf2Q5NC05 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttf2Q5NC05 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttf2Q5NC05 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttf2Q5NC05 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttf2Q5NC05 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttf2Q5NC05 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttf2Q5NC05 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttf2Q5NC05 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttf2Q5NC05 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttf2Q5NC05 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttf2Q5NC05 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttf2Q5NC05 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttf2Q5NC05 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttf2Q5NC05 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttf2Q5NC05 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttf2Q5NC05 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttf2Q5NC05 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttf2Q5NC05 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttf2Q5NC05 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttf2Q5NC05 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttf2Q5NC05 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttf2Q5NC05 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttf2Q5NC05 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttf2Q5NC05 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttf2Q5NC05 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttf2Q5NC05 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttf2Q5NC05 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttf2Q5NC05 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttf2Q5NC05 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttf2Q5NC05 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttf2Q5NC05 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttf2Q5NC05 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttf2Q5NC05 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttf2Q5NC05 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttf2Q5NC05 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttf2Q5NC05 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttf2Q5NC05 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttf2Q5NC05 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttf2Q5NC05 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttf2Q5NC05 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttf2Q5NC05 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttf2Q5NC05 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttf2Q5NC05 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttf2Q5NC05 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttf2Q5NC05 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttf2Q5NC05 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttf2Q5NC05 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttf2Q5NC05 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms