Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU39

Vps41, Vacuolar protein sorting-associated protein 41 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps41Q5KU39 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms