Protein–RNA interactions for Protein: Q5G5D5

Syna, Syncytin-A, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynaQ5G5D5 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms