Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTK1

Chsy3, Chondroitin sulfate synthase 3, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy3Q5DTK1 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Chsy3Q5DTK1 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Chsy3Q5DTK1 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Chsy3Q5DTK1 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Chsy3Q5DTK1 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Chsy3Q5DTK1 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Chsy3Q5DTK1 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Chsy3Q5DTK1 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chsy3Q5DTK1 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chsy3Q5DTK1 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chsy3Q5DTK1 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chsy3Q5DTK1 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chsy3Q5DTK1 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chsy3Q5DTK1 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Chsy3Q5DTK1 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Chsy3Q5DTK1 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chsy3Q5DTK1 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chsy3Q5DTK1 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chsy3Q5DTK1 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Chsy3Q5DTK1 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Chsy3Q5DTK1 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Chsy3Q5DTK1 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Chsy3Q5DTK1 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chsy3Q5DTK1 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chsy3Q5DTK1 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chsy3Q5DTK1 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Chsy3Q5DTK1 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chsy3Q5DTK1 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Chsy3Q5DTK1 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chsy3Q5DTK1 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chsy3Q5DTK1 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chsy3Q5DTK1 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Chsy3Q5DTK1 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chsy3Q5DTK1 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chsy3Q5DTK1 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chsy3Q5DTK1 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Chsy3Q5DTK1 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chsy3Q5DTK1 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Chsy3Q5DTK1 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Chsy3Q5DTK1 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Chsy3Q5DTK1 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Chsy3Q5DTK1 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Chsy3Q5DTK1 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Chsy3Q5DTK1 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Chsy3Q5DTK1 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chsy3Q5DTK1 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chsy3Q5DTK1 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chsy3Q5DTK1 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chsy3Q5DTK1 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chsy3Q5DTK1 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chsy3Q5DTK1 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chsy3Q5DTK1 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chsy3Q5DTK1 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chsy3Q5DTK1 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Chsy3Q5DTK1 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chsy3Q5DTK1 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chsy3Q5DTK1 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chsy3Q5DTK1 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Chsy3Q5DTK1 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chsy3Q5DTK1 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chsy3Q5DTK1 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chsy3Q5DTK1 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chsy3Q5DTK1 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chsy3Q5DTK1 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Chsy3Q5DTK1 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Chsy3Q5DTK1 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chsy3Q5DTK1 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chsy3Q5DTK1 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chsy3Q5DTK1 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chsy3Q5DTK1 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Chsy3Q5DTK1 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Chsy3Q5DTK1 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chsy3Q5DTK1 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chsy3Q5DTK1 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chsy3Q5DTK1 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chsy3Q5DTK1 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chsy3Q5DTK1 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chsy3Q5DTK1 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chsy3Q5DTK1 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chsy3Q5DTK1 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chsy3Q5DTK1 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chsy3Q5DTK1 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chsy3Q5DTK1 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chsy3Q5DTK1 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chsy3Q5DTK1 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chsy3Q5DTK1 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chsy3Q5DTK1 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chsy3Q5DTK1 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Chsy3Q5DTK1 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Chsy3Q5DTK1 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Chsy3Q5DTK1 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Chsy3Q5DTK1 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Chsy3Q5DTK1 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Chsy3Q5DTK1 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Chsy3Q5DTK1 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Chsy3Q5DTK1 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
Chsy3Q5DTK1 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chsy3Q5DTK1 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chsy3Q5DTK1 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chsy3Q5DTK1 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms