Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDG0

Slc27a5, Bile acyl-CoA synthetase, mousemouse

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a5Q4LDG0 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc27a5Q4LDG0 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc27a5Q4LDG0 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc27a5Q4LDG0 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc27a5Q4LDG0 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc27a5Q4LDG0 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc27a5Q4LDG0 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Slc27a5Q4LDG0 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc27a5Q4LDG0 Gm29331-201ENSMUST00000187215 605 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc27a5Q4LDG0 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Slc27a5Q4LDG0 Gm43974-201ENSMUST00000205080 684 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Slc27a5Q4LDG0 Gm31409-201ENSMUST00000209894 710 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc27a5Q4LDG0 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc27a5Q4LDG0 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Slc27a5Q4LDG0 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc27a5Q4LDG0 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc27a5Q4LDG0 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc27a5Q4LDG0 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc27a5Q4LDG0 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc27a5Q4LDG0 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc27a5Q4LDG0 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc27a5Q4LDG0 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc27a5Q4LDG0 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc27a5Q4LDG0 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc27a5Q4LDG0 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Slc27a5Q4LDG0 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc27a5Q4LDG0 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc27a5Q4LDG0 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc27a5Q4LDG0 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc27a5Q4LDG0 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc27a5Q4LDG0 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc27a5Q4LDG0 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc27a5Q4LDG0 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc27a5Q4LDG0 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc27a5Q4LDG0 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc27a5Q4LDG0 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc27a5Q4LDG0 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc27a5Q4LDG0 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc27a5Q4LDG0 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc27a5Q4LDG0 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc27a5Q4LDG0 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc27a5Q4LDG0 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc27a5Q4LDG0 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc27a5Q4LDG0 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc27a5Q4LDG0 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc27a5Q4LDG0 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc27a5Q4LDG0 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc27a5Q4LDG0 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc27a5Q4LDG0 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc27a5Q4LDG0 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc27a5Q4LDG0 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc27a5Q4LDG0 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc27a5Q4LDG0 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc27a5Q4LDG0 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc27a5Q4LDG0 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc27a5Q4LDG0 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc27a5Q4LDG0 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc27a5Q4LDG0 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc27a5Q4LDG0 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc27a5Q4LDG0 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc27a5Q4LDG0 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc27a5Q4LDG0 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc27a5Q4LDG0 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc27a5Q4LDG0 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc27a5Q4LDG0 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc27a5Q4LDG0 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Slc27a5Q4LDG0 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc27a5Q4LDG0 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Slc27a5Q4LDG0 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc27a5Q4LDG0 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Slc27a5Q4LDG0 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc27a5Q4LDG0 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Slc27a5Q4LDG0 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc27a5Q4LDG0 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc27a5Q4LDG0 Vmn1r34-201ENSMUST00000074381 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc27a5Q4LDG0 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc27a5Q4LDG0 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc27a5Q4LDG0 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc27a5Q4LDG0 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Slc27a5Q4LDG0 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc27a5Q4LDG0 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc27a5Q4LDG0 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc27a5Q4LDG0 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc27a5Q4LDG0 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc27a5Q4LDG0 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc27a5Q4LDG0 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc27a5Q4LDG0 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc27a5Q4LDG0 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc27a5Q4LDG0 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc27a5Q4LDG0 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc27a5Q4LDG0 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc27a5Q4LDG0 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Slc27a5Q4LDG0 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc27a5Q4LDG0 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc27a5Q4LDG0 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc27a5Q4LDG0 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc27a5Q4LDG0 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc27a5Q4LDG0 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Slc27a5Q4LDG0 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc27a5Q4LDG0 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms