Protein–RNA interactions for Protein: Q497I4

Krt35, Keratin, type I cuticular Ha5, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt35Q497I4 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt35Q497I4 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt35Q497I4 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt35Q497I4 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt35Q497I4 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt35Q497I4 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt35Q497I4 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt35Q497I4 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt35Q497I4 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt35Q497I4 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt35Q497I4 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt35Q497I4 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt35Q497I4 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt35Q497I4 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt35Q497I4 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt35Q497I4 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt35Q497I4 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt35Q497I4 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt35Q497I4 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt35Q497I4 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt35Q497I4 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt35Q497I4 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt35Q497I4 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt35Q497I4 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt35Q497I4 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt35Q497I4 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt35Q497I4 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt35Q497I4 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt35Q497I4 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt35Q497I4 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Krt35Q497I4 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Krt35Q497I4 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Krt35Q497I4 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Krt35Q497I4 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms