Protein–RNA interactions for Protein: Q45KJ6

Lin28b, Protein lin-28 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin28bQ45KJ6 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lin28bQ45KJ6 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lin28bQ45KJ6 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lin28bQ45KJ6 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lin28bQ45KJ6 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Lin28bQ45KJ6 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Lin28bQ45KJ6 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Lin28bQ45KJ6 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lin28bQ45KJ6 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Lin28bQ45KJ6 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Lin28bQ45KJ6 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lin28bQ45KJ6 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Lin28bQ45KJ6 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lin28bQ45KJ6 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lin28bQ45KJ6 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lin28bQ45KJ6 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lin28bQ45KJ6 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lin28bQ45KJ6 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lin28bQ45KJ6 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lin28bQ45KJ6 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lin28bQ45KJ6 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lin28bQ45KJ6 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lin28bQ45KJ6 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lin28bQ45KJ6 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lin28bQ45KJ6 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lin28bQ45KJ6 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lin28bQ45KJ6 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lin28bQ45KJ6 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lin28bQ45KJ6 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lin28bQ45KJ6 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lin28bQ45KJ6 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lin28bQ45KJ6 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lin28bQ45KJ6 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lin28bQ45KJ6 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lin28bQ45KJ6 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lin28bQ45KJ6 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lin28bQ45KJ6 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lin28bQ45KJ6 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lin28bQ45KJ6 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lin28bQ45KJ6 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lin28bQ45KJ6 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lin28bQ45KJ6 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lin28bQ45KJ6 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Lin28bQ45KJ6 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lin28bQ45KJ6 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lin28bQ45KJ6 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Lin28bQ45KJ6 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lin28bQ45KJ6 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lin28bQ45KJ6 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Lin28bQ45KJ6 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lin28bQ45KJ6 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Lin28bQ45KJ6 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lin28bQ45KJ6 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lin28bQ45KJ6 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lin28bQ45KJ6 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lin28bQ45KJ6 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lin28bQ45KJ6 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lin28bQ45KJ6 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lin28bQ45KJ6 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lin28bQ45KJ6 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lin28bQ45KJ6 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lin28bQ45KJ6 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lin28bQ45KJ6 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lin28bQ45KJ6 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lin28bQ45KJ6 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lin28bQ45KJ6 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lin28bQ45KJ6 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lin28bQ45KJ6 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lin28bQ45KJ6 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lin28bQ45KJ6 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lin28bQ45KJ6 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lin28bQ45KJ6 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lin28bQ45KJ6 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lin28bQ45KJ6 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lin28bQ45KJ6 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lin28bQ45KJ6 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lin28bQ45KJ6 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lin28bQ45KJ6 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lin28bQ45KJ6 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lin28bQ45KJ6 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lin28bQ45KJ6 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lin28bQ45KJ6 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lin28bQ45KJ6 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Lin28bQ45KJ6 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lin28bQ45KJ6 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lin28bQ45KJ6 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lin28bQ45KJ6 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lin28bQ45KJ6 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lin28bQ45KJ6 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Lin28bQ45KJ6 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lin28bQ45KJ6 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Lin28bQ45KJ6 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lin28bQ45KJ6 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lin28bQ45KJ6 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lin28bQ45KJ6 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lin28bQ45KJ6 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lin28bQ45KJ6 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lin28bQ45KJ6 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lin28bQ45KJ6 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lin28bQ45KJ6 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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