Protein–RNA interactions for Protein: Q3V089

Rbm44, RNA-binding protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 1,013 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm44Q3V089 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbm44Q3V089 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbm44Q3V089 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbm44Q3V089 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbm44Q3V089 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbm44Q3V089 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbm44Q3V089 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbm44Q3V089 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbm44Q3V089 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbm44Q3V089 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbm44Q3V089 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbm44Q3V089 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbm44Q3V089 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbm44Q3V089 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbm44Q3V089 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbm44Q3V089 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbm44Q3V089 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbm44Q3V089 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbm44Q3V089 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbm44Q3V089 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbm44Q3V089 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbm44Q3V089 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbm44Q3V089 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbm44Q3V089 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbm44Q3V089 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbm44Q3V089 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbm44Q3V089 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbm44Q3V089 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbm44Q3V089 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbm44Q3V089 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbm44Q3V089 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbm44Q3V089 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbm44Q3V089 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbm44Q3V089 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbm44Q3V089 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbm44Q3V089 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbm44Q3V089 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbm44Q3V089 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbm44Q3V089 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbm44Q3V089 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbm44Q3V089 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbm44Q3V089 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbm44Q3V089 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbm44Q3V089 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbm44Q3V089 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbm44Q3V089 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbm44Q3V089 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbm44Q3V089 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbm44Q3V089 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbm44Q3V089 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbm44Q3V089 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbm44Q3V089 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbm44Q3V089 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbm44Q3V089 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbm44Q3V089 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbm44Q3V089 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbm44Q3V089 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbm44Q3V089 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbm44Q3V089 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbm44Q3V089 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbm44Q3V089 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbm44Q3V089 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbm44Q3V089 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbm44Q3V089 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbm44Q3V089 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbm44Q3V089 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbm44Q3V089 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbm44Q3V089 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbm44Q3V089 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbm44Q3V089 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbm44Q3V089 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbm44Q3V089 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbm44Q3V089 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbm44Q3V089 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbm44Q3V089 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbm44Q3V089 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbm44Q3V089 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbm44Q3V089 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbm44Q3V089 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbm44Q3V089 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbm44Q3V089 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbm44Q3V089 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbm44Q3V089 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbm44Q3V089 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbm44Q3V089 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbm44Q3V089 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbm44Q3V089 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbm44Q3V089 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbm44Q3V089 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbm44Q3V089 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbm44Q3V089 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbm44Q3V089 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbm44Q3V089 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbm44Q3V089 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbm44Q3V089 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbm44Q3V089 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbm44Q3V089 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbm44Q3V089 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbm44Q3V089 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbm44Q3V089 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms