Protein–RNA interactions for Protein: Q3V009

Tmed1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed1Q3V009 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmed1Q3V009 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmed1Q3V009 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmed1Q3V009 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmed1Q3V009 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmed1Q3V009 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmed1Q3V009 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmed1Q3V009 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmed1Q3V009 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmed1Q3V009 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmed1Q3V009 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmed1Q3V009 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmed1Q3V009 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmed1Q3V009 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmed1Q3V009 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmed1Q3V009 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmed1Q3V009 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmed1Q3V009 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmed1Q3V009 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmed1Q3V009 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmed1Q3V009 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmed1Q3V009 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmed1Q3V009 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmed1Q3V009 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmed1Q3V009 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmed1Q3V009 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmed1Q3V009 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmed1Q3V009 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmed1Q3V009 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmed1Q3V009 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmed1Q3V009 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmed1Q3V009 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmed1Q3V009 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmed1Q3V009 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmed1Q3V009 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmed1Q3V009 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmed1Q3V009 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmed1Q3V009 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmed1Q3V009 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmed1Q3V009 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmed1Q3V009 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmed1Q3V009 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmed1Q3V009 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmed1Q3V009 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmed1Q3V009 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmed1Q3V009 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmed1Q3V009 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmed1Q3V009 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmed1Q3V009 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmed1Q3V009 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmed1Q3V009 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmed1Q3V009 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmed1Q3V009 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmed1Q3V009 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed1Q3V009 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed1Q3V009 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed1Q3V009 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed1Q3V009 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed1Q3V009 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed1Q3V009 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed1Q3V009 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed1Q3V009 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed1Q3V009 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed1Q3V009 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed1Q3V009 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed1Q3V009 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed1Q3V009 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed1Q3V009 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed1Q3V009 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed1Q3V009 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed1Q3V009 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed1Q3V009 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed1Q3V009 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed1Q3V009 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed1Q3V009 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed1Q3V009 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed1Q3V009 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed1Q3V009 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed1Q3V009 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed1Q3V009 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed1Q3V009 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed1Q3V009 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed1Q3V009 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed1Q3V009 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed1Q3V009 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed1Q3V009 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed1Q3V009 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed1Q3V009 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed1Q3V009 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed1Q3V009 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed1Q3V009 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed1Q3V009 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed1Q3V009 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed1Q3V009 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed1Q3V009 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed1Q3V009 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmed1Q3V009 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmed1Q3V009 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmed1Q3V009 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmed1Q3V009 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms