Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW98

Clca4b, Chloride channel accessory 4B, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca4bQ3UW98 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms