Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms