Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms