Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp30Q3UN04 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp30Q3UN04 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp30Q3UN04 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp30Q3UN04 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp30Q3UN04 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp30Q3UN04 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp30Q3UN04 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp30Q3UN04 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp30Q3UN04 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp30Q3UN04 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp30Q3UN04 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp30Q3UN04 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp30Q3UN04 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp30Q3UN04 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp30Q3UN04 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp30Q3UN04 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp30Q3UN04 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp30Q3UN04 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp30Q3UN04 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp30Q3UN04 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp30Q3UN04 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp30Q3UN04 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp30Q3UN04 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp30Q3UN04 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp30Q3UN04 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp30Q3UN04 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp30Q3UN04 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp30Q3UN04 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp30Q3UN04 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp30Q3UN04 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp30Q3UN04 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp30Q3UN04 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp30Q3UN04 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp30Q3UN04 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp30Q3UN04 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp30Q3UN04 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp30Q3UN04 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp30Q3UN04 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp30Q3UN04 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp30Q3UN04 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp30Q3UN04 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp30Q3UN04 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms