Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL53

Crxos, Cone-rod homeobox, opposite strand, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxosQ3UL53 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CrxosQ3UL53 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CrxosQ3UL53 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CrxosQ3UL53 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CrxosQ3UL53 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CrxosQ3UL53 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CrxosQ3UL53 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CrxosQ3UL53 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CrxosQ3UL53 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CrxosQ3UL53 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CrxosQ3UL53 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CrxosQ3UL53 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CrxosQ3UL53 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CrxosQ3UL53 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CrxosQ3UL53 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CrxosQ3UL53 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CrxosQ3UL53 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CrxosQ3UL53 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CrxosQ3UL53 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CrxosQ3UL53 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CrxosQ3UL53 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CrxosQ3UL53 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CrxosQ3UL53 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CrxosQ3UL53 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CrxosQ3UL53 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CrxosQ3UL53 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CrxosQ3UL53 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CrxosQ3UL53 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CrxosQ3UL53 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CrxosQ3UL53 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CrxosQ3UL53 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CrxosQ3UL53 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CrxosQ3UL53 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CrxosQ3UL53 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CrxosQ3UL53 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CrxosQ3UL53 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CrxosQ3UL53 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CrxosQ3UL53 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CrxosQ3UL53 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CrxosQ3UL53 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CrxosQ3UL53 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CrxosQ3UL53 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CrxosQ3UL53 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CrxosQ3UL53 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CrxosQ3UL53 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CrxosQ3UL53 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CrxosQ3UL53 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CrxosQ3UL53 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CrxosQ3UL53 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CrxosQ3UL53 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CrxosQ3UL53 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CrxosQ3UL53 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CrxosQ3UL53 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CrxosQ3UL53 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CrxosQ3UL53 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CrxosQ3UL53 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CrxosQ3UL53 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CrxosQ3UL53 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CrxosQ3UL53 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CrxosQ3UL53 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CrxosQ3UL53 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CrxosQ3UL53 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CrxosQ3UL53 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CrxosQ3UL53 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CrxosQ3UL53 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CrxosQ3UL53 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CrxosQ3UL53 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CrxosQ3UL53 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CrxosQ3UL53 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CrxosQ3UL53 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CrxosQ3UL53 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CrxosQ3UL53 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CrxosQ3UL53 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CrxosQ3UL53 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CrxosQ3UL53 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CrxosQ3UL53 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CrxosQ3UL53 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CrxosQ3UL53 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CrxosQ3UL53 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CrxosQ3UL53 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CrxosQ3UL53 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CrxosQ3UL53 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CrxosQ3UL53 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CrxosQ3UL53 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CrxosQ3UL53 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CrxosQ3UL53 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CrxosQ3UL53 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CrxosQ3UL53 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
CrxosQ3UL53 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CrxosQ3UL53 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CrxosQ3UL53 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CrxosQ3UL53 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CrxosQ3UL53 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CrxosQ3UL53 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
CrxosQ3UL53 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CrxosQ3UL53 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CrxosQ3UL53 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CrxosQ3UL53 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CrxosQ3UL53 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CrxosQ3UL53 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms