Protein–RNA interactions for Protein: Q3UK78

Pcgf5, Polycomb group RING finger protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf5Q3UK78 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms