Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sf3b2Q3UJB0 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sf3b2Q3UJB0 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sf3b2Q3UJB0 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sf3b2Q3UJB0 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sf3b2Q3UJB0 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sf3b2Q3UJB0 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sf3b2Q3UJB0 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sf3b2Q3UJB0 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sf3b2Q3UJB0 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sf3b2Q3UJB0 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sf3b2Q3UJB0 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sf3b2Q3UJB0 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sf3b2Q3UJB0 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sf3b2Q3UJB0 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sf3b2Q3UJB0 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sf3b2Q3UJB0 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sf3b2Q3UJB0 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sf3b2Q3UJB0 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sf3b2Q3UJB0 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Sf3b2Q3UJB0 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sf3b2Q3UJB0 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sf3b2Q3UJB0 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sf3b2Q3UJB0 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sf3b2Q3UJB0 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sf3b2Q3UJB0 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sf3b2Q3UJB0 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sf3b2Q3UJB0 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sf3b2Q3UJB0 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sf3b2Q3UJB0 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sf3b2Q3UJB0 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sf3b2Q3UJB0 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sf3b2Q3UJB0 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sf3b2Q3UJB0 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sf3b2Q3UJB0 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sf3b2Q3UJB0 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sf3b2Q3UJB0 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sf3b2Q3UJB0 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sf3b2Q3UJB0 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sf3b2Q3UJB0 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sf3b2Q3UJB0 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sf3b2Q3UJB0 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sf3b2Q3UJB0 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sf3b2Q3UJB0 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Sf3b2Q3UJB0 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Sf3b2Q3UJB0 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Sf3b2Q3UJB0 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sf3b2Q3UJB0 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sf3b2Q3UJB0 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sf3b2Q3UJB0 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sf3b2Q3UJB0 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Sf3b2Q3UJB0 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sf3b2Q3UJB0 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sf3b2Q3UJB0 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sf3b2Q3UJB0 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sf3b2Q3UJB0 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sf3b2Q3UJB0 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sf3b2Q3UJB0 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sf3b2Q3UJB0 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sf3b2Q3UJB0 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sf3b2Q3UJB0 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sf3b2Q3UJB0 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sf3b2Q3UJB0 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sf3b2Q3UJB0 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sf3b2Q3UJB0 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sf3b2Q3UJB0 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sf3b2Q3UJB0 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms