Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

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Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nkx6-3Q3UHX8 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nkx6-3Q3UHX8 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nkx6-3Q3UHX8 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nkx6-3Q3UHX8 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nkx6-3Q3UHX8 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nkx6-3Q3UHX8 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nkx6-3Q3UHX8 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nkx6-3Q3UHX8 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nkx6-3Q3UHX8 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nkx6-3Q3UHX8 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nkx6-3Q3UHX8 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Nkx6-3Q3UHX8 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nkx6-3Q3UHX8 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nkx6-3Q3UHX8 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Nkx6-3Q3UHX8 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nkx6-3Q3UHX8 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nkx6-3Q3UHX8 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nkx6-3Q3UHX8 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nkx6-3Q3UHX8 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nkx6-3Q3UHX8 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nkx6-3Q3UHX8 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nkx6-3Q3UHX8 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nkx6-3Q3UHX8 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nkx6-3Q3UHX8 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nkx6-3Q3UHX8 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Nkx6-3Q3UHX8 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nkx6-3Q3UHX8 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nkx6-3Q3UHX8 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nkx6-3Q3UHX8 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nkx6-3Q3UHX8 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nkx6-3Q3UHX8 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nkx6-3Q3UHX8 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nkx6-3Q3UHX8 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nkx6-3Q3UHX8 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nkx6-3Q3UHX8 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nkx6-3Q3UHX8 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nkx6-3Q3UHX8 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nkx6-3Q3UHX8 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Nkx6-3Q3UHX8 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Nkx6-3Q3UHX8 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nkx6-3Q3UHX8 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nkx6-3Q3UHX8 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nkx6-3Q3UHX8 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nkx6-3Q3UHX8 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nkx6-3Q3UHX8 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nkx6-3Q3UHX8 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nkx6-3Q3UHX8 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nkx6-3Q3UHX8 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nkx6-3Q3UHX8 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nkx6-3Q3UHX8 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nkx6-3Q3UHX8 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nkx6-3Q3UHX8 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nkx6-3Q3UHX8 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nkx6-3Q3UHX8 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nkx6-3Q3UHX8 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nkx6-3Q3UHX8 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nkx6-3Q3UHX8 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nkx6-3Q3UHX8 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nkx6-3Q3UHX8 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nkx6-3Q3UHX8 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nkx6-3Q3UHX8 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nkx6-3Q3UHX8 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nkx6-3Q3UHX8 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nkx6-3Q3UHX8 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nkx6-3Q3UHX8 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Nkx6-3Q3UHX8 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nkx6-3Q3UHX8 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Nkx6-3Q3UHX8 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nkx6-3Q3UHX8 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nkx6-3Q3UHX8 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nkx6-3Q3UHX8 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Nkx6-3Q3UHX8 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
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Nkx6-3Q3UHX8 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nkx6-3Q3UHX8 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nkx6-3Q3UHX8 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nkx6-3Q3UHX8 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nkx6-3Q3UHX8 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nkx6-3Q3UHX8 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nkx6-3Q3UHX8 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nkx6-3Q3UHX8 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nkx6-3Q3UHX8 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nkx6-3Q3UHX8 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nkx6-3Q3UHX8 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nkx6-3Q3UHX8 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nkx6-3Q3UHX8 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nkx6-3Q3UHX8 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nkx6-3Q3UHX8 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nkx6-3Q3UHX8 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nkx6-3Q3UHX8 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nkx6-3Q3UHX8 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nkx6-3Q3UHX8 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nkx6-3Q3UHX8 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nkx6-3Q3UHX8 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
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