Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFM5

Nom1, Nucleolar MIF4G domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nom1Q3UFM5 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nom1Q3UFM5 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nom1Q3UFM5 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nom1Q3UFM5 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nom1Q3UFM5 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nom1Q3UFM5 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nom1Q3UFM5 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nom1Q3UFM5 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nom1Q3UFM5 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nom1Q3UFM5 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Nom1Q3UFM5 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nom1Q3UFM5 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nom1Q3UFM5 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Nom1Q3UFM5 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nom1Q3UFM5 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nom1Q3UFM5 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nom1Q3UFM5 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nom1Q3UFM5 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nom1Q3UFM5 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nom1Q3UFM5 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nom1Q3UFM5 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nom1Q3UFM5 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nom1Q3UFM5 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nom1Q3UFM5 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nom1Q3UFM5 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Nom1Q3UFM5 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nom1Q3UFM5 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nom1Q3UFM5 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nom1Q3UFM5 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nom1Q3UFM5 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nom1Q3UFM5 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nom1Q3UFM5 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nom1Q3UFM5 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nom1Q3UFM5 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nom1Q3UFM5 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nom1Q3UFM5 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nom1Q3UFM5 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nom1Q3UFM5 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nom1Q3UFM5 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nom1Q3UFM5 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nom1Q3UFM5 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nom1Q3UFM5 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nom1Q3UFM5 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Nom1Q3UFM5 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nom1Q3UFM5 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nom1Q3UFM5 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nom1Q3UFM5 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nom1Q3UFM5 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nom1Q3UFM5 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nom1Q3UFM5 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nom1Q3UFM5 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nom1Q3UFM5 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nom1Q3UFM5 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nom1Q3UFM5 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nom1Q3UFM5 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nom1Q3UFM5 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nom1Q3UFM5 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nom1Q3UFM5 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nom1Q3UFM5 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nom1Q3UFM5 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Nom1Q3UFM5 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nom1Q3UFM5 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nom1Q3UFM5 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nom1Q3UFM5 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nom1Q3UFM5 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nom1Q3UFM5 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nom1Q3UFM5 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nom1Q3UFM5 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nom1Q3UFM5 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nom1Q3UFM5 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nom1Q3UFM5 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nom1Q3UFM5 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nom1Q3UFM5 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nom1Q3UFM5 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nom1Q3UFM5 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nom1Q3UFM5 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nom1Q3UFM5 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nom1Q3UFM5 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nom1Q3UFM5 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nom1Q3UFM5 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nom1Q3UFM5 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nom1Q3UFM5 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nom1Q3UFM5 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nom1Q3UFM5 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nom1Q3UFM5 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Nom1Q3UFM5 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Nom1Q3UFM5 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Nom1Q3UFM5 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nom1Q3UFM5 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nom1Q3UFM5 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nom1Q3UFM5 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nom1Q3UFM5 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nom1Q3UFM5 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nom1Q3UFM5 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nom1Q3UFM5 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nom1Q3UFM5 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nom1Q3UFM5 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nom1Q3UFM5 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nom1Q3UFM5 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Nom1Q3UFM5 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms