Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14301-201ENSMUST00000120181 324 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Gm21118-202ENSMUST00000187418 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20877-202ENSMUST00000191358 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Gtpbp6Q3U6U5 4930568A13Rik-201ENSMUST00000199961 1061 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gtpbp6Q3U6U5 A930002H02Rik-201ENSMUST00000208672 1178 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Gtpbp6Q3U6U5 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14126-201ENSMUST00000122345 395 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Gm39375-201ENSMUST00000217068 1039 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Gm19990-201ENSMUST00000219468 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45610-201ENSMUST00000209227 784 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9520-201ENSMUST00000209460 1253 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 4930532G15Rik-202ENSMUST00000195314 1457 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12752-201ENSMUST00000121657 811 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14133-201ENSMUST00000139471 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5656-201ENSMUST00000171020 1096 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 A630023A22Rik-201ENSMUST00000178958 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Gm35216-201ENSMUST00000203777 433 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms