Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

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Length 105 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q3U595 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q3U595 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q3U595 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q3U595 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q3U595 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q3U595 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q3U595 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q3U595 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q3U595 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q3U595 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q3U595 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q3U595 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q3U595 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q3U595 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q3U595 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q3U595 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q3U595 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q3U595 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q3U595 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q3U595 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q3U595 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Q3U595 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Q3U595 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Q3U595 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q3U595 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q3U595 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q3U595 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Q3U595 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q3U595 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q3U595 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q3U595 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q3U595 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q3U595 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q3U595 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q3U595 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q3U595 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q3U595 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q3U595 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Q3U595 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q3U595 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q3U595 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q3U595 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q3U595 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q3U595 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q3U595 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q3U595 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q3U595 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q3U595 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q3U595 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q3U595 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Q3U595 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q3U595 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q3U595 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q3U595 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q3U595 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q3U595 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q3U595 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q3U595 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q3U595 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q3U595 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q3U595 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q3U595 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q3U595 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q3U595 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q3U595 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q3U595 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q3U595 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q3U595 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q3U595 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q3U595 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q3U595 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q3U595 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q3U595 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q3U595 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q3U595 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q3U595 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q3U595 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q3U595 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q3U595 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q3U595 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Q3U595 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q3U595 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Q3U595 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q3U595 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q3U595 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q3U595 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q3U595 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q3U595 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q3U595 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q3U595 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q3U595 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Q3U595 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q3U595 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q3U595 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q3U595 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q3U595 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q3U595 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q3U595 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q3U595 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms