Protein–RNA interactions for Protein: Q3U435

Mmp25, Matrix metalloproteinase-25, mousemouse

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Length 615 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp25Q3U435 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp25Q3U435 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp25Q3U435 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp25Q3U435 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp25Q3U435 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp25Q3U435 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp25Q3U435 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp25Q3U435 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp25Q3U435 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp25Q3U435 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp25Q3U435 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp25Q3U435 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp25Q3U435 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp25Q3U435 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp25Q3U435 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp25Q3U435 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp25Q3U435 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp25Q3U435 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp25Q3U435 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp25Q3U435 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp25Q3U435 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp25Q3U435 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp25Q3U435 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp25Q3U435 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp25Q3U435 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp25Q3U435 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp25Q3U435 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp25Q3U435 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp25Q3U435 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp25Q3U435 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp25Q3U435 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp25Q3U435 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp25Q3U435 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp25Q3U435 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp25Q3U435 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp25Q3U435 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp25Q3U435 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp25Q3U435 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp25Q3U435 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp25Q3U435 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp25Q3U435 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp25Q3U435 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp25Q3U435 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp25Q3U435 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp25Q3U435 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp25Q3U435 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp25Q3U435 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Mmp25Q3U435 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp25Q3U435 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp25Q3U435 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp25Q3U435 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp25Q3U435 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp25Q3U435 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Mmp25Q3U435 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Mmp25Q3U435 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Mmp25Q3U435 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Mmp25Q3U435 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Mmp25Q3U435 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Mmp25Q3U435 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Mmp25Q3U435 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp25Q3U435 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp25Q3U435 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp25Q3U435 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Mmp25Q3U435 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp25Q3U435 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp25Q3U435 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp25Q3U435 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp25Q3U435 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp25Q3U435 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp25Q3U435 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp25Q3U435 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp25Q3U435 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp25Q3U435 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp25Q3U435 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp25Q3U435 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp25Q3U435 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp25Q3U435 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp25Q3U435 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp25Q3U435 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp25Q3U435 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp25Q3U435 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp25Q3U435 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp25Q3U435 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp25Q3U435 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp25Q3U435 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp25Q3U435 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp25Q3U435 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp25Q3U435 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp25Q3U435 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp25Q3U435 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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