Protein–RNA interactions for Protein: Q3U319

Rnf40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, mousemouse

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf40Q3U319 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
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Rnf40Q3U319 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf40Q3U319 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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Rnf40Q3U319 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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Rnf40Q3U319 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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Rnf40Q3U319 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf40Q3U319 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf40Q3U319 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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Rnf40Q3U319 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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Rnf40Q3U319 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf40Q3U319 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf40Q3U319 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf40Q3U319 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf40Q3U319 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf40Q3U319 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf40Q3U319 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf40Q3U319 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf40Q3U319 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf40Q3U319 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf40Q3U319 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf40Q3U319 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf40Q3U319 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf40Q3U319 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf40Q3U319 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf40Q3U319 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf40Q3U319 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf40Q3U319 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
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