Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1F9

Pag1, Phosphoprotein associated with glycosphingolipid-enriched microdomains 1, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pag1Q3U1F9 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pag1Q3U1F9 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pag1Q3U1F9 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pag1Q3U1F9 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pag1Q3U1F9 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms