Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0J8

Tbc1d2b, TBC1 domain family member 2B, mousemouse

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d2bQ3U0J8 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tbc1d2bQ3U0J8 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tbc1d2bQ3U0J8 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tbc1d2bQ3U0J8 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tbc1d2bQ3U0J8 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Tbc1d2bQ3U0J8 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tbc1d2bQ3U0J8 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tbc1d2bQ3U0J8 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tbc1d2bQ3U0J8 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tbc1d2bQ3U0J8 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tbc1d2bQ3U0J8 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tbc1d2bQ3U0J8 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tbc1d2bQ3U0J8 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tbc1d2bQ3U0J8 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tbc1d2bQ3U0J8 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tbc1d2bQ3U0J8 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tbc1d2bQ3U0J8 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Tbc1d2bQ3U0J8 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tbc1d2bQ3U0J8 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tbc1d2bQ3U0J8 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tbc1d2bQ3U0J8 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tbc1d2bQ3U0J8 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tbc1d2bQ3U0J8 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tbc1d2bQ3U0J8 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tbc1d2bQ3U0J8 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tbc1d2bQ3U0J8 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tbc1d2bQ3U0J8 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tbc1d2bQ3U0J8 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tbc1d2bQ3U0J8 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tbc1d2bQ3U0J8 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tbc1d2bQ3U0J8 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tbc1d2bQ3U0J8 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tbc1d2bQ3U0J8 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tbc1d2bQ3U0J8 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tbc1d2bQ3U0J8 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tbc1d2bQ3U0J8 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tbc1d2bQ3U0J8 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tbc1d2bQ3U0J8 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tbc1d2bQ3U0J8 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tbc1d2bQ3U0J8 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tbc1d2bQ3U0J8 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tbc1d2bQ3U0J8 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tbc1d2bQ3U0J8 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tbc1d2bQ3U0J8 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tbc1d2bQ3U0J8 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tbc1d2bQ3U0J8 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tbc1d2bQ3U0J8 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tbc1d2bQ3U0J8 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tbc1d2bQ3U0J8 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tbc1d2bQ3U0J8 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tbc1d2bQ3U0J8 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tbc1d2bQ3U0J8 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tbc1d2bQ3U0J8 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tbc1d2bQ3U0J8 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tbc1d2bQ3U0J8 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Tbc1d2bQ3U0J8 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Tbc1d2bQ3U0J8 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tbc1d2bQ3U0J8 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tbc1d2bQ3U0J8 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tbc1d2bQ3U0J8 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tbc1d2bQ3U0J8 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tbc1d2bQ3U0J8 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tbc1d2bQ3U0J8 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tbc1d2bQ3U0J8 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tbc1d2bQ3U0J8 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tbc1d2bQ3U0J8 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Tbc1d2bQ3U0J8 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tbc1d2bQ3U0J8 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tbc1d2bQ3U0J8 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tbc1d2bQ3U0J8 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tbc1d2bQ3U0J8 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tbc1d2bQ3U0J8 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tbc1d2bQ3U0J8 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tbc1d2bQ3U0J8 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tbc1d2bQ3U0J8 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tbc1d2bQ3U0J8 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tbc1d2bQ3U0J8 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tbc1d2bQ3U0J8 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tbc1d2bQ3U0J8 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tbc1d2bQ3U0J8 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tbc1d2bQ3U0J8 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tbc1d2bQ3U0J8 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tbc1d2bQ3U0J8 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tbc1d2bQ3U0J8 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tbc1d2bQ3U0J8 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tbc1d2bQ3U0J8 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tbc1d2bQ3U0J8 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tbc1d2bQ3U0J8 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tbc1d2bQ3U0J8 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tbc1d2bQ3U0J8 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tbc1d2bQ3U0J8 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tbc1d2bQ3U0J8 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms