Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms