Protein–RNA interactions for Protein: Q3TS39

1700066B19Rik, RIKEN cDNA 1700066B19 gene, mousemouse

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Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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1700066B19RikQ3TS39 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
1700066B19RikQ3TS39 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
1700066B19RikQ3TS39 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
1700066B19RikQ3TS39 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
1700066B19RikQ3TS39 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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1700066B19RikQ3TS39 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
1700066B19RikQ3TS39 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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1700066B19RikQ3TS39 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
1700066B19RikQ3TS39 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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1700066B19RikQ3TS39 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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1700066B19RikQ3TS39 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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1700066B19RikQ3TS39 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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1700066B19RikQ3TS39 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
1700066B19RikQ3TS39 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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1700066B19RikQ3TS39 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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1700066B19RikQ3TS39 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
1700066B19RikQ3TS39 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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1700066B19RikQ3TS39 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
1700066B19RikQ3TS39 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
1700066B19RikQ3TS39 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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1700066B19RikQ3TS39 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
1700066B19RikQ3TS39 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
1700066B19RikQ3TS39 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
1700066B19RikQ3TS39 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
1700066B19RikQ3TS39 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
1700066B19RikQ3TS39 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
1700066B19RikQ3TS39 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
1700066B19RikQ3TS39 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
1700066B19RikQ3TS39 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
1700066B19RikQ3TS39 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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1700066B19RikQ3TS39 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
1700066B19RikQ3TS39 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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1700066B19RikQ3TS39 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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1700066B19RikQ3TS39 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
1700066B19RikQ3TS39 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
1700066B19RikQ3TS39 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
1700066B19RikQ3TS39 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
1700066B19RikQ3TS39 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
1700066B19RikQ3TS39 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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1700066B19RikQ3TS39 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
1700066B19RikQ3TS39 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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1700066B19RikQ3TS39 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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