Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQQ9

Uncharacterized protein C1orf112 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 903 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TQQ9 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q3TQQ9 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q3TQQ9 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q3TQQ9 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q3TQQ9 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q3TQQ9 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q3TQQ9 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q3TQQ9 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q3TQQ9 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q3TQQ9 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q3TQQ9 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3TQQ9 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3TQQ9 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3TQQ9 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3TQQ9 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3TQQ9 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3TQQ9 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3TQQ9 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3TQQ9 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3TQQ9 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3TQQ9 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3TQQ9 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3TQQ9 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3TQQ9 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3TQQ9 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3TQQ9 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3TQQ9 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3TQQ9 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3TQQ9 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3TQQ9 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3TQQ9 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3TQQ9 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3TQQ9 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3TQQ9 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3TQQ9 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3TQQ9 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3TQQ9 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3TQQ9 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3TQQ9 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3TQQ9 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3TQQ9 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3TQQ9 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3TQQ9 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3TQQ9 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3TQQ9 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3TQQ9 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3TQQ9 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3TQQ9 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3TQQ9 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3TQQ9 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3TQQ9 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3TQQ9 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3TQQ9 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3TQQ9 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3TQQ9 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3TQQ9 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3TQQ9 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3TQQ9 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3TQQ9 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3TQQ9 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3TQQ9 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3TQQ9 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3TQQ9 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3TQQ9 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3TQQ9 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3TQQ9 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3TQQ9 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3TQQ9 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3TQQ9 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3TQQ9 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3TQQ9 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3TQQ9 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3TQQ9 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3TQQ9 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3TQQ9 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3TQQ9 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3TQQ9 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3TQQ9 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3TQQ9 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3TQQ9 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3TQQ9 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q3TQQ9 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q3TQQ9 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q3TQQ9 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q3TQQ9 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q3TQQ9 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3TQQ9 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3TQQ9 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3TQQ9 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3TQQ9 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3TQQ9 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3TQQ9 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3TQQ9 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3TQQ9 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3TQQ9 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3TQQ9 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3TQQ9 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3TQQ9 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3TQQ9 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3TQQ9 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms