Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

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Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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