Protein–RNA interactions for Protein: Q3THK3

Gtf2f1, General transcription factor IIF subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2f1Q3THK3 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gtf2f1Q3THK3 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gtf2f1Q3THK3 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gtf2f1Q3THK3 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gtf2f1Q3THK3 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gtf2f1Q3THK3 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf2f1Q3THK3 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf2f1Q3THK3 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf2f1Q3THK3 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf2f1Q3THK3 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf2f1Q3THK3 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf2f1Q3THK3 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf2f1Q3THK3 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf2f1Q3THK3 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf2f1Q3THK3 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf2f1Q3THK3 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf2f1Q3THK3 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf2f1Q3THK3 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf2f1Q3THK3 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf2f1Q3THK3 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf2f1Q3THK3 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf2f1Q3THK3 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf2f1Q3THK3 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf2f1Q3THK3 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf2f1Q3THK3 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf2f1Q3THK3 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms